"Less Pain, More Life"    
publications
Journal Papers
 
S. Giatili and G. Stamatakos. In Silico Simulation of Glioblastoma Growth and Invasion into the Human Brain Including an Explicit Modelling of the Adiabatic Boundary Condition Imposed by the Skull. Journal of Applied Electromagnetism. 2017
Link    Download File
 
Nikolaos A. Christodoulou, Nikolaos E. Tousert, Eleni Ch. Georgiadi, Katerina D. Argyri, Fay D. Misichroni and Georgios S. Stamatakos. A Modular Repository-based Infrastructure for Simulation Model Storage and Execution Support in the Context of In Silico Oncology and In Silico Medicine. Cancer Informatics. 2016(15) 219-235 2016
Link    Download File
 
Eleni Kolokotroni, Dimitra Dionysiou, Christian Veith, Yoo-Jin Kim, Jorg Sabczynski, Astrid Franz, Aleksandar Grgic, Jan Palm, Rainer M. Bohle, Georgios Stamatakos. In Silico Oncology: Quantification of the In Vivo Antitumor Efficacy of Cisplatin-Based Doublet Therapy in Non-Small Cell Lung Cancer (NSCLC) through a Multiscale Mechanistic Model. PLoS Computational Biology, 12(9), 2016
Link   
 
Bucur A, van Leeuwen J, Christodoulou N, Sigdel K, Argyri K, Koumakis L, Graf N and Stamatakos G Workflow-driven clinical decision support for personalized oncology, BMC Medical Informatics and Decision Making, 16, 151-162, 2016
Download File
 
Argyri KD, Dionysiou DD, Misichroni FD, Stamatakos GS Numerical simulation of vascular tumour growth under antiangiogenic treatment: addressing the paradigm of single-agent bevacizumab therapy with the use of experimental data, Biology Direct, 11, 2016
Download File
 
Ouzounoglou E, Dionysiou D, Stamatakos GS Differentiation resistance through altered retinoblastoma protein function in acute lymphoblastic leukemia: in silico modeling of the deregulations in the G1/S restriction point pathway, BMC Systems Biology, 10, 2016
Download File
 
Markos Antonopoulos and Georgios Stamatakos "In Silico Neuro-Oncology: Brownian Motion-Based Mathematical Treatment as a Potential Platform for Modeling the Infiltration of Glioma Cells into Normal Brain Tissue" Libertas Academica 2015
Download File
 
G.Stamatakos, "In silico oncology and in silico medicine: from research to clinics and academia." MINERVA UROL NEFROL 67(Suppl. 1 to No 1), 43-44, 2015
 
G.Stamatakos, "A brief outline of the CHIC project." MINERVA UROL NEFROL 67 (Suppl. 1 to No 1), 5-6, 2015
 
G Stamatakos, Memeber , IEEE , D Dionysiou, A Lunzer, R Belleman, E Kolokotroni, E Georgiadi, M Erdt, J Pukacki, S Rueping, S Giatili, A d`Onofrio, S Sfakianakis, K Marias, Member , IEEE , C Desmedt, M Tsiknakis, Member , IEEE , and N Graf, Member , IEEE "The Technologically Integrated Oncosimulator: Combining Multiscale Cancer Modeling with Information Technology in the In Silico Oncology Context" DOI:10.1109/JBHI.2013.2284276 IEEE J Biomedical and Health Informatics vol.18, No. 3, pp.840-854 2014
Link   
 
O. Wolkenhauer, C. Auffray, O. Brass, J. Clairambault, A. Deutsch, D. Drasdo, F. Gervasio, L. Preziosi, P. Maini, A. Marciniak-Czochra, C. Kossow, L. Kuepfer, K. Rateitschak, I. Ramis-Conde, B. Ribba, A. Schuppert, R Smallwood, G. Stamatakos, Felix Winter, and Helen Byrne. "Enabling multiscale modeling in systems medicine." Genome Medicine 6:21, 2014
Link   
 
V Sakkalis, S Sfakianakis, E Tzamali, K Marias , G Stamatakos, F Misichroni, E. Ouzounoglou, E Kolokotroni, D Dionysiou, D Johnson, S McKeever, and N Graf "Web-based workflow planning platform supporting the design and execution of complex multiscale cancer models." IEEE J Biomed Health Inform 2014, in press. 2014
 
G. Stamatakos, N. Graf, R. Radhakrishnan "Multiscale Cancer Modeling and In Silico Oncology: Emerging Computational Frontiers in Basic and Translational Cancer Research" Journal of Bioengineering & Biomedical Science 3:e114. 2013. doi: 10.4172/2155-9538.1000e114 2013
Link   
 
David Johnson, Steve McKeever, Georgios Stamatakos, Dimitra Dionysiou, Norbert Graf, Vangelis. Sakkalis, Konstantinos Marias, Zhihui Wang, Thomas S. Deisboeck "Dealing with Diversity in Computational Cancer Modeling". Cancer Informatics 12: 115-124, 2013
Link   
 
E.C.Georgiadi, D.D.Dionysiou, N.Graf, G.Stamatakos, "Towards In Silico Oncology: Adapting a Four Dimensional Nephroblastoma Treatment Model to a Clinical Trial Case Based on Multi-Method Sensitivity Analysis." Computers in Biology and Medicine, in press, doi: 10.1016/j.compbiomed.2012.08.008. Epub 2012 Oct 10. vol.42 (11) pp. 1064-1078 2012
Link   
 
S.Giatili and G.Stamatakos "A Detailed Numerical Treatment of the Boundary Conditions Imposed by the Skull on a Diffusion-Reaction Model of Glioma Tumor Growth. Clinical Validation Aspects." Applied Mathematics and Computation Appl. Math. Comput. vol.218(17) (Issue 17) pp. 8779-8799 2012
Link   
 
S. Bauer, C. May, D. Dionysiou, G. Stamatakos, P. Buechler, M. Reyes Multi-Scale modeling for image analysis of brain tumor studies IEEE Trans. Biomed. Eng. DOI:10.1109/TBME.2011.2163406 59(1), pp. 25-29 2011
Link   
 
C.May, E.Kolokotroni, G. StamatakoS,P.Buechler Coupling biomechanics to a cellular level model: an approach to patient-specific image driven multi-scale and multi-physics tumor simulation Progress in Biophysics and Molecular Biology, vol. 107(1) pp. 193-199 2011
Link   
 
K. Marias, D. Dionysiou, V. Sakkalis, N. Graf, R. M. Bohle, P. V. Coveney, S. Wan, A. Folarin, P. Buechler, M. Reyes, G. Clapworthy, E. Liu, J. Sabczynski, T. Bily, A. Roniotis, M. Tsiknakis, E. Kolokotroni, S. Giatili, C. Veith, E. Messe, H. Stenzhorn, Yoo-Jin Kim, S. Zasada, A. N. Haidar, C. May, S. Bauer, T. Wang, Y. Zhao, M. Karasek, R. Grewer, A. Franz and G. Stamatakos, Clinically driven design of multi-scale cancer models: the ContraCancrum project paradigm, Interface Focus, June 6, 2011 1:281-285 2011
Link   
 
G.S.Stamatakos, E.Ch.Georgiadi, N.Graf, E.A.Kolokotroni, and D.D.Dionysiou, "Exploiting Clinical Trial Data Drastically Narrows the Window of Possible Solutions to the Problem of Clinical Adaptation of a Multiscale Cancer Model", PLOS ONE 6(3), e17594, 2011
Link    Download File
 
E.A. Kolokotroni, D.D. Dionysiou, N.K. Uzunoglu, G.S. Stamatakos, "Studying the growth kinetics of untreated clinical tumors by using an advanced discrete simulation model", Mathematical and Computer Modelling, 54 1989-2006 2011
Link   
 
G.S.Stamatakos, E.A.Kolokotroni, D.D.Dionysiou, E.Ch.Georgiadi, C.Desmedt. An advanced discrete state - discrete event multiscale simulation model of the response of a solid tumor to chemotherapy: Mimicking a clinical study. Journal of Theoretical Biology 266, 124-139, 2010
Link   
 
T. Athanaileas, A.Menychtas, D.Dionysiou, D. Kyriazis, D.Kaklamani, T.Varvarigou, N.Uzunoglu and G.Stamatakos. Exploiting Grid Technologies for the Simulation of Clinical Trials In Silico: the Paradigm of In Silico Radiation Oncology. SIMULATION, first published on July 9, 2010 as doi:10.1177/0037549710375437 2010
Link   
 
G.S.Stamatakos, D.D. Dionysiou Introduction of Hypermatrix and Operator Notation into a Discrete Mathematics Simulation Model of Malignant Tumour Response to Therapeutic Schemes In Vivo. Some Operator Properties Cancer Informatics 7, 239 - 251, 2009
Link    Download File
 
N. Graf, A. Hoppe , E. Georgiadi, R. Belleman, C. Desmedt, D. Dionysiou, M. Erdt , J. Jacques, E. Kolokotroni, A. Lunzer, M. Tsiknakis, G. Stamatakos "In Silico Oncology" for Clinical Decision Making in the Context of Nephroblastoma. [Die Bedeutung von ,in silico Onkologie` zur klinischen Entscheidungsfindung am Beispiel des Nephroblastoms ] Klin. Paediatr. (Klinische Paediatrie) 221, 141-149, 2009
Link   
 
D.D. Dionysiou, G.S. Stamatakos, D. Gintides, N. Uzunoglu, K. Kyriaki Critical Parameters Determining Standard Radiotherapy Treatment Outcome for Glioblastoma Multiforme: A Computer Simulation The Open Biomedical Engineering Journal 2, 43-51, 2008
Link    Download File
 
N.Graf,C.Desmedt,F.Buffa,D.Kafetzopoulos,N.Forgo,R.Kollek,A.Hoppe,G.Stamatakos,M.Tsiknakis Post-genomic clinical trials - The perspective of ACGT, Ecancermedicalscience Vol. 2, 2008
Link   
 
D.D.Dionysiou, G.S.Stamatakos, K.Marias, Simulating cancer radiotherapy on a multi-level basis: biology, oncology and image processing, Lecture Notes in Computer Science, 4561, 569-575, 2007
Link   
 
K.Marias, D.Dionysiou, G.S. Stamatakos, F.Zacharopoulou, E.Georgiadi, T.G.Maris, I.Tollis, Multi-level analysis and information extraction considerations for validating 4D models of human function, Lecture Notes in Computer Science, 4561, 703-709, 2007
Link   
 
N. Graf, C. Desmedt, A. Hoppe, M. Tsiknakis, D. Dionysiou, G. Stamatakos , Clinical requirements of In Silico Oncology as part of the integrated project ACGT (Advancing Clinico-Genomic Trials on Cancer) , European Journal of Cancer Supplements , 5(4) , 83 , 2007
Link   
 
V.P.Antipas, G.S.Stamatakos, N.K.Uzunoglu , A patient-specific in vivo tumor and normal tissue model for prediction of the response to radiotherapy: a computer simulation approach , Methods Inf. Med. , 46 , 367-375 , 2007
Link   
 
G. Stamatakos , Spotlight on Cancer Informatics , Cancer Informatics , 2 , 83-86, 2007
Link    Download File
 
D.D.Dionysiou and G.S.Stamatakos, Applying a 4D multiscale in vivo tumor growth model to the exploration of radiotherapy scheduling: the effects of weekend treatment gaps and p53 gene status on the response of fast growing solid tumors, Cancer Informatics, 2, 113-121, 2006
Link    Download File
 
D.D.Dionysiou, G.S. Stamatakos, N.K.Uzunoglu, K.S.Nikita , A computer simulation of in vivo tumour growth and response to radiotherapy: new algorithms and parametric results , Computers in Biology and Medicine , 36 , 448-464 , 2006
Link   
 
Stamatakos GS, Antipas VP, Uzunoglu NK. Simulating chemotherapeutic schemes in the individualized treatment context: the paradigm of glioblastoma multiforme treated by temozolomide in vivo. Comput Biol Med. 36(11) 1216-34 2006
Link   
 
G.S.Stamatakos, V.P.Antipas, N.K.Uzunoglu, R.G.Dale , A four dimensional computer simulation model of the in vivo response to radiotherapy of glioblastoma multiforme: studies on the effect of clonogenic cell density , British Journal of Radiology , 79 , 389-400 , 2006
Link   
 
G.S.Stamatakos, V.P.Antipas, and N.K. Uzunoglu , A spatiotemporal, patient individualized simulation model of solid tumor response to chemotherapy in vivo: the paradigm of glioblastoma multiforme treated by temozolomide , IEEE Transactions on Biomedical Engineering , 53(8) , 1467-1477 , 2006
Link    Download File
 
D.D.Dionysiou, G.S. Stamatakos, N.K.Uzunoglu, K.S.Nikita, A. Marioli , A Four Dimensional In Vivo Model of Tumour Response to Radiotherapy: Parametric Validation Considering Radiosensitivity, Genetic Profile and Fractionation , J. theor. Biol. , 230 , 1-20 , 2004
Link   
 
V.P.Antipas, G.S.Stamatakos, N.K.Uzunoglu, D.D. Dionysiou, R.G.Dale , A spatiotemporal simulation model of the response of solid tumors to radiotherapy in vivo: parametric validation concerning oxygen enhancement ratio and cell cycle duration , Phys Med Biol , 49(8) , 1485-1504 , 2004
Link   
 
E.I.Zacharaki, G.S.Stamatakos, K.S.Nikita, N.K.Uzunoglu , Simulating growth dynamics and radiation response of avascular tumour spheroid model validation in the case of an EMT6/Ro multicellular spheroid , Computer Methods and Programs in Biomedicine , 76 , 193-206 , 2004
Link   
 
V.Antipas, G.Stamatakos, N.Uzunoglu, M.Synodinou , A four dimensional simulation model of the response of solid tumours to radiotherapy in vivo: advances and validation , European Journal of Cancer , EJC Supplements Vol. 1, No 5 , S162-S163 , 2003
Link   
 
G.S. Stamatakos, D.D. Dionysiou, E.I. Zacharaki, N.A. Mouravliansky, K.S.Nikita, N.K. & Uzunoglu , In silico radiation oncology: combining novel simulation algorithms with current visualization techniques , IEEE Proceedings: Special Issue on Bioinformatics: Advances and Chalenges , 90(11) , 1764-1777 , 2002
Link    Download File
 
G. Stamatakos, D.Dionysiou, K.Nikita, N.Zamboglou, D.Baltas, G.Pissakas, N.Uzunoglu , In vivo tumour growth and response to radiation therapy: a novel algorithmic description , Int. J. Radiat. Oncol. Biol. Phys. , 51, Sup. 1 , 240 , 2001
Link   
 
G.Stamatakos, E.I. Zacharaki, N.K. Uzunoglu, K.S. Nikita , Tumor growth and response to irradiation in vitro: a technologically advanced simulation model , Int. J. Radiation Oncology, Biology, Physics , 51, No 3, Sup. 1, , 240-241 , 2001
Link   
 
G.Stamatakos, E.Zacharaki, M.Makropoulou, N.Mouravliansky, A.Marsh, K.Nikita, and N.Uzunoglu , Modeling tumor growth and irradiation response in vitro- a combination of high-performance computing and web based technologies including VRML visualization , IEEE Trans. Inform. Technology Biomedicine , , Vol. 5, No 4 , 279-289 , 2001
Link   
 
G.Stamatakos, E.Zacharaki, M.Makropoulou, N.Mouravliansky, K.Nikita, N.Uzunoglu , Tumour growth in vitro and tumour response to irradiation schemes: a simulation model and virtual reality visualization , Radiotherapy and Oncology , 56, Sup. 1 , S179-S180 , 2000
Link   
 
Stamatakos GS, Uzunoglu NK, Delibasis K, Mouravliansky N, Marsh A, Makropoulou M. Tumor growth simulation and visualization: a review and a Web based paradigm. Stud Health Technol Inform. 79 255-74 2000
Link   
 
G.S.Stamatakos, E.Zacharaki, N.Mouravliansky, K.K.Delibasis, K.S.Nikita, N.Uzunoglu, A.Marsh , Using Web Technologies and Meta-Computing to Visualise a Simplified Simulation Model of Tumor Growth in Vitro , Lecture Notes in Computer Science , 1593 , 973-982 , 1999
Link   
 
G.Stamatakos, N.Uzunoglu, K.Delibasis, M.Makropoulou, N.Mouravliansky, A.Marsh, "A simplified simulation model and virtual reality visualization of tumor growth in vitro," Future Generation Computer Systems, 14, 79-89, 1998
Link   
 
PLEASE NOTE:

1.THE COPYRIGHTS TO THE PUBLICATIONS ARE HELD BY THEIR PUBLISHERS. THE PDF FILES PROVIDED IN THIS WEB SITE MAY BE USED ONLY FOR SINGLE COPIES FOR PERSONAL USE, AS THOUGH THEY WERE REPRINTS PROVIDED BY MAIL. THEY MAY NOT BE REPOSTED ON OTHER WEB SITES OR USED FOR ANY OTHER PURPOSE WITHOUT THE EXPRESS PERMISSION OF THE APPROPRIATE PUBLISHERS.

2.A NUMBER OF REPRESENTATIVE BIOMEDICAL JOURNAL PAPERS NOT STRICTLY RELATED TO IN SILICO ONCOLOGY CAN BE FOUND IN THE SECTION "Other Publications" 0000
 

ΕΝΑΡΞΗ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ

ΤΟ ΝΕΟ ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟ ΜΑΘΗΜΑ ΤΗΣ ΣΧΟΛΗΣ ΗΛΕΚΤΡΟΛΟΓΩΝ ΜΗΧΑΝΙΚΩΝ ΚΑΙ ΜΗΧΑΝΙΚΩΝ ΥΠΟΛΟΓΙΣΤΩΝ ΕΜΠ ME TIΤΛΟ: "(705) Πολυκλιμακωτή Προσομοίωση της Ασθένειας του Καρκίνου και In Silico Ιατρική " ΔΙΔΑΣΚΕΤΑΙ ΓΙΑ TΡΙΤΗ ΧΡΟΝΙΑ ΚΑΤΑ ΤΟ ΧΕΙΜΕΡΙΝΟ ΕΞΑΜΗΝΟ 2016-2017 Περίληψη του μαθήματος υπάρχει στον Οδηγό Μεταπτυχιακών Σπουδών της ΣΗΜΜΥ Σημειώνεται ότι το εν λόγω μάθημα είναι το πρώτο διεθνώς μεταπτυχιακό μάθημα αφιερωμένο στην αναδυόμενη επιστημονική και τεχνολογική περιοχή της In Silico Ιατρικής.
http://www.vph-institute.org/news/new-postgraduate-subject-on-multiscale-cancer-modelling-and-in-silico-medicine-mscm-ism.html

http://chic-vph.eu/highlights/details/article/first-postgraduate-course-on-in-silico-medicine/

 
ΑΝΑΒΟΛΗ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ


ΑΝΑΒΟΛΗ ΤΟΥ ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟΥ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ ΤΗΣ ΣΗΜΜΥ ΜΕ ΤΙΤΛΟ (705)

"ΠΟΛΥΚΛΙΜΑΚΩΤΗ ΠΡΟΣΟΜΟΙΩΣΗ
ΤΗΣ ΑΣΘΕΝΕΙΑΣ ΤΟΥ ΚΑΡΚΙΝΟΥ
ΚΑΙ IN SILICO ΙΑΤΡΙΚΗ"
ΤΗΣ ΠΑΡΑΣΚΕΥΗΣ 23 ΟΚΤΩΒΡΙΟΥ 2015 ΑΝΑΒΑΛΛΕΤΑΙ ΛΟΓΩ ΑΝΕΛΑΣΤΙΚΗΣ ΑΠΟΥΣΙΑΣ ΤΟΥ ΔΙΔΑΣΚΟΝΤΑ ΣΤΟ ΕΞΩΤΕΡΙΚΟ. ΤΟ ΜΑΘΗΜΑ ΤΗΣ 30ης ΟΚΤ. ΘΑ ΓΙΝΕΙ ΚΑΝΟΝΙΚΑ

 


ΕΝΑΡΞΗ ΤΟΥ ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟΥ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ ΤΗΣ ΣΗΜΜΥ ΜΕ ΤΙΤΛΟ (705)

"ΠΟΛΥΚΛΙΜΑΚΩΤΗ ΠΡΟΣΟΜΟΙΩΣΗ
ΤΗΣ ΑΣΘΕΝΕΙΑΣ ΤΟΥ ΚΑΡΚΙΝΟΥ
ΚΑΙ IN SILICO ΙΑΤΡΙΚΗ"


Διδάσκων: Γ. Σταματάκος
Ημέρα:Παρασκευή 16 Οκτωβρίου 2015
(και κάθε Παρασκευή)
Ωρες: 13.45-17.00
Κτήριο: Nέo Κτίριο ΣΗΜΜΥ
Αιθουσα: 101, 1os όροφος
Επικοινωνία:gestam@central.ntua.gr

Περισσότερες πληροφορίες

Εισήγηση,Τεκμηρίωση, Διδακτικό Υλικό και Αναλυτική Περιγραφή του Νέου Μεταπτ. Μαθήματος της ΣΗΜΜΥ

New postgraduate subject on Multiscale Cancer Modelling and In Silico Medicine (MSCM & ISM)/VPH Institute

 
IEEE XPLORE PUBLICATION OF PROCEEDINGS


The Proceedings of the 6th International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology and Cancer Investigation - The CHIC Project Workshop (6th IARWISOCI) have been published - following the standard IEEE review - in the IEEE Xplore Digital Library

http://ieeexplore.ieee.org/xpl/mostRecentIssue.jsp?punumber=7024236

Since except for the editorial, the abstracts and some additional front matter, downloading of any paper requires either a special subscription to IEEE or electronic payment, you might prefer to cite any paper through its IEEE Xplore publication and at the same time read and disseminate it for free via its open access publication

THE CHIC PROJECT WORKSHOP 2014 PROCEEDINGS OPEN ACCESS VERSION.pdf

which resides in the workshop website http://6th-iarwisoci.iccs.ntua.gr/. It is noted that a special agreement with IEEE has been signed regarding the parallel open access and IEEE Xplore publishing of the proceedings.

 
ΘΕΣΗ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΗΣ ΕΡΓΑΣΙΑΣ

Η ΘΕΣΗ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΕΧΕΙ ΚΑΛΥΦΘΕΙ

Η Ομάδα για την In Silico Ογκολογία και την In Silico Ιατρική (www.in-silico-oncology.iccs.ntua.gr) του Εργαστηρίου Μικροκυμάτων και Οπτικών Ινών, του Ερευνητικού Πανεπιστημιακού Ινστιτούτου Συστημάτων Επικοινωνιών και Υπολογιστών του Εθνικού Μετσοβίου Πολυτεχνείου (ΕΠΙΣΕΥ-ΕΜΠ), ενδιαφέρεται για την πλήρωση μίας θέσης ερευνητικής εργασίας, με σύμβαση έργου, στα πλαίσια της υλοποίησης ευρωπαϊκών και διεθνών ερευνητικών προγραμμάτων.

Η θέση εργασίας αφορά στην περιοχή της πολυεπίπεδης/πολυκλιμακωτής υπολογιστικής προσομοίωσης του καρκίνου και της in silico ογκολογίας. Οι υποψήφιοι μπορεί να είναι διπλωματούχοι ή διδάκτορες Ηλεκτρολόγοι Μηχανικοί και Μηχανικοί Υπολογιστών ή διπλωματούχοι/διδάκτορες άλλων Πολυτεχνικών Σχολών ή Σχολών Πληροφορικής με ειδίκευση στις Τεχνολογίες Λογισμικού.

Θα επιλεγούν υποψήφιοι χωρίς άλλες σπουδαστικές, επαγγελματικές ή ακαδημαϊκές υποχρεώσεις έτσι ώστε να μπορέσουν να αφοσιωθούν αποκλειστικά στις ερευνητικές δραστηριότητες της ομάδας. Το ύψος της αμοιβής θα προσδιοριστεί ανάλογα με την επιστημονική εξειδίκευση και την εμπειρία των υποψηφίων. Το ενδεχόμενο εκπόνησης διδακτορικής διατριβής για μη κατόχους διδακτορικού διπλώματος στα παραπάνω πλαίσια θα εξεταστεί κατά περίπτωση.

Οι υποψήφιοι θα πρέπει να ενδιαφέρονται για την εφαρμογή των τεχνολογιών λογισμικού στο χώρο της in silico (υπολογιστικής) Ιατρικής και Βιολογίας. Συγκεκριμένα, η θέση εργασίας αφορά στους εξής βασικούς άξονες:

* Ανάπτυξη υπολογιστικών συστημάτων αποθήκευσης και διαχείρισης ογκοπροσομοιωτικών μοντέλων και αντίστοιχων πολυκλιμακωτών ιατρικών/βιολογικών δεδομένων (σχεδιασμός και υλοποίηση σχετικών λογισμικών υποδομής και διεπιφανειών χρήστη).
* Σχεδιασμός, υλοποίηση και έλεγχος της αρχιτεκτονικής σύνθετων συστημάτων λογισμικού τα οποία θα προσλαμβάνουν, θα αποθηκεύουν και θα επεξεργάζονται ετερογενή και πολυδιάστατα βιοϊατρικά δεδομένα, θα εκτελούν σχετικούς υπολογιστικούς κώδικες σε συστήματα υψηλής υπολογιστικής απόδοσης (clusters, grid, cloud κλπ.) και θα οπτικοποιούν τα αποτελέσματα παρέχοντας εξόδους σε μορφές φιλικές προς το χρήστη.

Επιθυμητές γνώσεις/εμπειρία:

* Εκτεταμένες γνώσεις επιστήμης υπολογιστών.
* Θα εκτιμηθούν ιδιαίτερα ειδικές γνώσεις/εμπειρία σε: relational databases (e.g. MySQL, PostgressSQL), web application technologies (e.g. AJAX, Javascript, PHP, Python), NoSQL databases (MongoDB), virtualization and cloud computing, C++/Matlab/SBML/Java programming, Semantics and Ontologies (e.g. MarkUp Languages, RDF, OWL, Triple Stores, SPARQL).

Πρόσθετα Επιθυμητά χαρακτηριστικά:

* Αναλυτική και συνδυαστική ικανότητα.
* Ικανότητα συνεργασίας σε διεθνές και διεπιστημονικό περιβάλλον εργασίας.

Οι ενδιαφερόμενοι παρακαλούνται να αποστείλουν το συντομότερο δυνατό το βιογραφικό τους σημείωμα στις ηλεκτρονικές διευθύνσεις:

gestam@central.ntua.gr και dimdio@esd.ece.ntua.gr

Αθήνα, 8 Μαΐου 2014

Γ. Σταματάκος
Ερευνητής Α ΕΠΙΣΕΥ-ΕΜΠ
Διευθυντής Ερευνών

Download
------------------------------------------------------------

 
ΘΕΣΗ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΣΕ ΕΥΡΩΠΑЇΚΑ KAI ΔΙΕΘΝΗ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΑ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΑ

Η Ομάδα για την In Silico Ογκολογία (www.in-silico-oncology.iccs.ntua.gr) του Εργαστηρίου Μικροκυμάτων και Οπτικών Ινών, του Ερευνητικού Πανεπιστημιακού Ινστιτούτου Συστημάτων Επικοινωνιών και Υπολογιστών του Εθνικού Μετσοβίου Πολυτεχνείου (ΕΠΙΣΕΥ-ΕΜΠ), ενδιαφέρεται για την πλήρωση μίας θέσης ερευνητικής εργασίας, με σύμβαση έργου, στα πλαίσια της υλοποίησης ευρωπαϊκών και διεθνών ερευνητικών προγραμμάτων.

Περισσότερες πληροφορίες

 
CHIC project presented in The Parliament Magazine

A one page general public article on the CHIC project has been published in The Parliament Magazine 389, 28 April 2014, p. 36.

More

 
ΘΕΣΕΙΣ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΣΕ ΕΥΡΩΠΑЇΚΑ KAI ΔΙΕΘΝΗ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΑ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΑ

ΟΙ ΘΕΣΕΙΣ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΕΧΟΥΝ ΚΑΛΥΦΘΕΙ

ΘΕΣΕΙΣ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΣΕ ΕΥΡΩΠΑЇΚΑ KAI ΔΙΕΘΝΗ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΑ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΑ

Η Ομάδα για την In Silico Ογκολογία (www.in-silico-oncology.iccs.ntua.gr) του Εργαστηρίου Μικροκυμάτων και Οπτικών Ινών, του Ερευνητικού Πανεπιστημιακού Ινστιτούτο Συστημάτων Επικοινωνιών και Υπολογιστών του Εθνικού Μετσοβίου Πολυτεχνείου (ΕΠΙΣΕΥ-ΕΜΠ), ενδιαφέρεται για την πλήρωση τριών θέσεων ερευνητικής εργασίας, με σύμβαση έργου, στα πλαίσια της υλοποίησης ευρωπαϊκών και διεθνών ερευνητικών προγραμμάτων.

Περισσότερες πληροφορίες

 
5th IARWISOCI -TUMOR project workshop

The 5th International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology and Cancer Investigation (5th IARWISOCI) - TUMOR project workshop will take place in Athens on October 22-23, 2012.
View Workshop Web Page

 
NEW BOOK

" Multiscale Cancer Modeling "

by T.Deisboeck (*) and G. Stamatakos (**) Eds,

CRC Press,2011

[ *Massachusetts General Hospital and Harvard Medical School ,
** Institute of Communication and Computer Systems, National Technical University of Athens]

In both printed and ebook format

More

 
In Silico medicine reaches the clinic

cordis.europa.eu

Forget the monopoly of in vitro, the study of biology in test tubes. The real cutting edge of medical science is in silico, and European researchers have just achieved a world first in the field.

ACGT's most innovative and advanced support tool is its oncosimulator, a piece of mathematical modelling, simulation and visualisation software and an in silico experimental platform.

The In Silico Oncology Group (http://www.in-silico-oncology.iccs.ntua.gr) is developing this platform in collaboration with several research centres in Europe and Japan.

Full article

 
First Summer School in Computational Oncology
Heraklion, Crete, Greece - June 13th-18th, 2011


The summer school is for both clinicians/medical students and engineers/basic scientists/engineering students who wish to learn the principles of computational oncology from pioneers in the field.
The scope of this summer school is to provide basic training on the new research dimension of computational oncology based on the experience of four European collaborative projects in this direction (ACGT, ContraCancrum, TUMOR and pmedicine).
For more information please visit the webpage:
www.computationaloncology.org

 
PROCEEDINGS OF THE 4th INTERNATIONAL ADVANCED RESEARCH WORKSHOP ON IN SILICO ONCOLOGY AND CANCER INVESTIGATION - THE CONTRA CANCRUM WORKSHOP

The Proceedings of the workshop can be downloaded from the workshop website www.4th-iarwisoci.iccs.ntua.gr

 
4th International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology and Cancer Investigation

4th International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology and Cancer Investigation (4th IARWISOCI).
8-9 September 2010
Athens, Greece.

View workshop webpage:
4th IARWISOCI

 
OFFICIAL REPORT ON THE FIRST TRANSATLANTIC WORKSHOP ON MULTISCALE CANCER MODELING, Brussels, Oct. 23-24, 2008

Report

 
1st Transatlantic Workshop on Multiscale Cancer Modelling


1st Transatlantic Workshop on Multiscale Cancer Modelling: an ICT BIO event coorganized by NCI and EC,
October 23-24, 2008
Brussels, Belgium

View the workshop webpage:
ICT BIO 2008

MEDICAL RESEARCH AT CROSSROADS

 
3rd International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology


Third International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology: Advances and Challenges (3rd IARWISO)
September 23-24, 2008 Istanbul, Turkey.

View workshop webpage:
3rd IARWISO