"Less Pain, More Life"      
group members
Georgios S. Stamatakos GROUP LEADER PhD, Research Professor
Short Biography    

Georgios S. Stamatakos received the Diploma degree in electrical engineering from the National Technical University of Athens (NTUA), Athens, Greece, the M.Sc. degree in bioengineering from the University of Strathclyde, Glasgow, Scotland, U.K., and the Ph.D. degree in physics (biophysics) from NTUA. He is a Research Professor of Analysis and Simulation of Biological Systems and their Interaction with Electromagnetic Radiation at the Institute of Communication and Computer Systems, NTUA where he has founded and leads the In Silico Oncology Group. He is also a member of the teaching staff of the School of Electrical and Computer Engineering, NTUA. The focus of his research group is on in silico oncology, in silico medicine, systems medicine and multiscale cancer modeling. He has also worked as a researcher in bioinformatics, systems biology, biooptics, bioelectromagnetics and computational electromagnetics. He has proposed the notion and the system of Oncosimulator. He has led the development of the Oncosimulator of the European Commission (EC) and Japan co-funded ACGT integrated project as well as of the Oncosimulators of several other EC funded and international projects mostly centred around the initiative of the Virtual Physiological Human (VPH). He is the scientific coordinator of the EC funded EU-US large scale integrating research project entitled "CHIC: Computational Horizons in Cancer: Developing Meta- and Hyper-Multiscale Models and Repositories forIn Silico Oncology" FP7-ICT-2011-9, Grant Agreement no 600841. He has also proposed the term and the notion of in silico oncology denoting a new clinical trial driven scientific and technological discipline. He is the author or co-author of more than 120 international peer-reviewed publications. He has coinitiated and coorganized a number of international research workshops, including the series of International Advanced Research Workshops on In Silico Oncology and Cancer Investigation and the First Transatlantic (EU-US) Workshop on Multiscale Cancer Modeling (ICT 2008, Brussels 2008). The latter was cofunded by the European Commission and the National Cancer Institute, US. G. Stamatakos has been a co-editor, contributor, and reviewer of the transatlantic multiauthor textbook entitled Multiscale Cancer Modeling published by CRC Press (2010/2011). He is a member of IEEE, CViT, the VPH Institute, and the Technical Chamber of Greece.


ΕΝΑΡΞΗ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ

ΤΟ ΝΕΟ ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟ ΜΑΘΗΜΑ ΤΗΣ ΣΧΟΛΗΣ ΗΛΕΚΤΡΟΛΟΓΩΝ ΜΗΧΑΝΙΚΩΝ ΚΑΙ ΜΗΧΑΝΙΚΩΝ ΥΠΟΛΟΓΙΣΤΩΝ ΕΜΠ ME TIΤΛΟ: "(705) Πολυκλιμακωτή Προσομοίωση της Ασθένειας του Καρκίνου και In Silico Ιατρική " ΔΙΔΑΣΚΕΤΑΙ ΓΙΑ TΡΙΤΗ ΧΡΟΝΙΑ ΚΑΤΑ ΤΟ ΧΕΙΜΕΡΙΝΟ ΕΞΑΜΗΝΟ 2016-2017 Περίληψη του μαθήματος υπάρχει στον Οδηγό Μεταπτυχιακών Σπουδών της ΣΗΜΜΥ Σημειώνεται ότι το εν λόγω μάθημα είναι το πρώτο διεθνώς μεταπτυχιακό μάθημα αφιερωμένο στην αναδυόμενη επιστημονική και τεχνολογική περιοχή της In Silico Ιατρικής.
http://www.vph-institute.org/news/new-postgraduate-subject-on-multiscale-cancer-modelling-and-in-silico-medicine-mscm-ism.html

http://chic-vph.eu/highlights/details/article/first-postgraduate-course-on-in-silico-medicine/

 
ΑΝΑΒΟΛΗ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ


ΑΝΑΒΟΛΗ ΤΟΥ ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟΥ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ ΤΗΣ ΣΗΜΜΥ ΜΕ ΤΙΤΛΟ (705)

"ΠΟΛΥΚΛΙΜΑΚΩΤΗ ΠΡΟΣΟΜΟΙΩΣΗ
ΤΗΣ ΑΣΘΕΝΕΙΑΣ ΤΟΥ ΚΑΡΚΙΝΟΥ
ΚΑΙ IN SILICO ΙΑΤΡΙΚΗ"
ΤΗΣ ΠΑΡΑΣΚΕΥΗΣ 23 ΟΚΤΩΒΡΙΟΥ 2015 ΑΝΑΒΑΛΛΕΤΑΙ ΛΟΓΩ ΑΝΕΛΑΣΤΙΚΗΣ ΑΠΟΥΣΙΑΣ ΤΟΥ ΔΙΔΑΣΚΟΝΤΑ ΣΤΟ ΕΞΩΤΕΡΙΚΟ. ΤΟ ΜΑΘΗΜΑ ΤΗΣ 30ης ΟΚΤ. ΘΑ ΓΙΝΕΙ ΚΑΝΟΝΙΚΑ

 


ΕΝΑΡΞΗ ΤΟΥ ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟΥ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ ΤΗΣ ΣΗΜΜΥ ΜΕ ΤΙΤΛΟ (705)

"ΠΟΛΥΚΛΙΜΑΚΩΤΗ ΠΡΟΣΟΜΟΙΩΣΗ
ΤΗΣ ΑΣΘΕΝΕΙΑΣ ΤΟΥ ΚΑΡΚΙΝΟΥ
ΚΑΙ IN SILICO ΙΑΤΡΙΚΗ"


Διδάσκων: Γ. Σταματάκος
Ημέρα:Παρασκευή 16 Οκτωβρίου 2015
(και κάθε Παρασκευή)
Ωρες: 13.45-17.00
Κτήριο: Nέo Κτίριο ΣΗΜΜΥ
Αιθουσα: 101, 1os όροφος
Επικοινωνία:gestam@central.ntua.gr

Περισσότερες πληροφορίες

Εισήγηση,Τεκμηρίωση, Διδακτικό Υλικό και Αναλυτική Περιγραφή του Νέου Μεταπτ. Μαθήματος της ΣΗΜΜΥ

New postgraduate subject on Multiscale Cancer Modelling and In Silico Medicine (MSCM & ISM)/VPH Institute

 
IEEE XPLORE PUBLICATION OF PROCEEDINGS


The Proceedings of the 6th International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology and Cancer Investigation - The CHIC Project Workshop (6th IARWISOCI) have been published - following the standard IEEE review - in the IEEE Xplore Digital Library

http://ieeexplore.ieee.org/xpl/mostRecentIssue.jsp?punumber=7024236

Since except for the editorial, the abstracts and some additional front matter, downloading of any paper requires either a special subscription to IEEE or electronic payment, you might prefer to cite any paper through its IEEE Xplore publication and at the same time read and disseminate it for free via its open access publication

THE CHIC PROJECT WORKSHOP 2014 PROCEEDINGS OPEN ACCESS VERSION.pdf

which resides in the workshop website http://6th-iarwisoci.iccs.ntua.gr/. It is noted that a special agreement with IEEE has been signed regarding the parallel open access and IEEE Xplore publishing of the proceedings.

 
ΘΕΣΗ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΗΣ ΕΡΓΑΣΙΑΣ

Η ΘΕΣΗ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΕΧΕΙ ΚΑΛΥΦΘΕΙ

Η Ομάδα για την In Silico Ογκολογία και την In Silico Ιατρική (www.in-silico-oncology.iccs.ntua.gr) του Εργαστηρίου Μικροκυμάτων και Οπτικών Ινών, του Ερευνητικού Πανεπιστημιακού Ινστιτούτου Συστημάτων Επικοινωνιών και Υπολογιστών του Εθνικού Μετσοβίου Πολυτεχνείου (ΕΠΙΣΕΥ-ΕΜΠ), ενδιαφέρεται για την πλήρωση μίας θέσης ερευνητικής εργασίας, με σύμβαση έργου, στα πλαίσια της υλοποίησης ευρωπαϊκών και διεθνών ερευνητικών προγραμμάτων.

Η θέση εργασίας αφορά στην περιοχή της πολυεπίπεδης/πολυκλιμακωτής υπολογιστικής προσομοίωσης του καρκίνου και της in silico ογκολογίας. Οι υποψήφιοι μπορεί να είναι διπλωματούχοι ή διδάκτορες Ηλεκτρολόγοι Μηχανικοί και Μηχανικοί Υπολογιστών ή διπλωματούχοι/διδάκτορες άλλων Πολυτεχνικών Σχολών ή Σχολών Πληροφορικής με ειδίκευση στις Τεχνολογίες Λογισμικού.

Θα επιλεγούν υποψήφιοι χωρίς άλλες σπουδαστικές, επαγγελματικές ή ακαδημαϊκές υποχρεώσεις έτσι ώστε να μπορέσουν να αφοσιωθούν αποκλειστικά στις ερευνητικές δραστηριότητες της ομάδας. Το ύψος της αμοιβής θα προσδιοριστεί ανάλογα με την επιστημονική εξειδίκευση και την εμπειρία των υποψηφίων. Το ενδεχόμενο εκπόνησης διδακτορικής διατριβής για μη κατόχους διδακτορικού διπλώματος στα παραπάνω πλαίσια θα εξεταστεί κατά περίπτωση.

Οι υποψήφιοι θα πρέπει να ενδιαφέρονται για την εφαρμογή των τεχνολογιών λογισμικού στο χώρο της in silico (υπολογιστικής) Ιατρικής και Βιολογίας. Συγκεκριμένα, η θέση εργασίας αφορά στους εξής βασικούς άξονες:

* Ανάπτυξη υπολογιστικών συστημάτων αποθήκευσης και διαχείρισης ογκοπροσομοιωτικών μοντέλων και αντίστοιχων πολυκλιμακωτών ιατρικών/βιολογικών δεδομένων (σχεδιασμός και υλοποίηση σχετικών λογισμικών υποδομής και διεπιφανειών χρήστη).
* Σχεδιασμός, υλοποίηση και έλεγχος της αρχιτεκτονικής σύνθετων συστημάτων λογισμικού τα οποία θα προσλαμβάνουν, θα αποθηκεύουν και θα επεξεργάζονται ετερογενή και πολυδιάστατα βιοϊατρικά δεδομένα, θα εκτελούν σχετικούς υπολογιστικούς κώδικες σε συστήματα υψηλής υπολογιστικής απόδοσης (clusters, grid, cloud κλπ.) και θα οπτικοποιούν τα αποτελέσματα παρέχοντας εξόδους σε μορφές φιλικές προς το χρήστη.

Επιθυμητές γνώσεις/εμπειρία:

* Εκτεταμένες γνώσεις επιστήμης υπολογιστών.
* Θα εκτιμηθούν ιδιαίτερα ειδικές γνώσεις/εμπειρία σε: relational databases (e.g. MySQL, PostgressSQL), web application technologies (e.g. AJAX, Javascript, PHP, Python), NoSQL databases (MongoDB), virtualization and cloud computing, C++/Matlab/SBML/Java programming, Semantics and Ontologies (e.g. MarkUp Languages, RDF, OWL, Triple Stores, SPARQL).

Πρόσθετα Επιθυμητά χαρακτηριστικά:

* Αναλυτική και συνδυαστική ικανότητα.
* Ικανότητα συνεργασίας σε διεθνές και διεπιστημονικό περιβάλλον εργασίας.

Οι ενδιαφερόμενοι παρακαλούνται να αποστείλουν το συντομότερο δυνατό το βιογραφικό τους σημείωμα στις ηλεκτρονικές διευθύνσεις:

gestam@central.ntua.gr και dimdio@esd.ece.ntua.gr

Αθήνα, 8 Μαΐου 2014

Γ. Σταματάκος
Ερευνητής Α ΕΠΙΣΕΥ-ΕΜΠ
Διευθυντής Ερευνών

Download
------------------------------------------------------------

 
ΘΕΣΗ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΣΕ ΕΥΡΩΠΑЇΚΑ KAI ΔΙΕΘΝΗ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΑ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΑ

Η Ομάδα για την In Silico Ογκολογία (www.in-silico-oncology.iccs.ntua.gr) του Εργαστηρίου Μικροκυμάτων και Οπτικών Ινών, του Ερευνητικού Πανεπιστημιακού Ινστιτούτου Συστημάτων Επικοινωνιών και Υπολογιστών του Εθνικού Μετσοβίου Πολυτεχνείου (ΕΠΙΣΕΥ-ΕΜΠ), ενδιαφέρεται για την πλήρωση μίας θέσης ερευνητικής εργασίας, με σύμβαση έργου, στα πλαίσια της υλοποίησης ευρωπαϊκών και διεθνών ερευνητικών προγραμμάτων.

Περισσότερες πληροφορίες

 
CHIC project presented in The Parliament Magazine

A one page general public article on the CHIC project has been published in The Parliament Magazine 389, 28 April 2014, p. 36.

More

 
ΘΕΣΕΙΣ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΣΕ ΕΥΡΩΠΑЇΚΑ KAI ΔΙΕΘΝΗ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΑ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΑ

ΟΙ ΘΕΣΕΙΣ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΕΧΟΥΝ ΚΑΛΥΦΘΕΙ

ΘΕΣΕΙΣ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΣΕ ΕΥΡΩΠΑЇΚΑ KAI ΔΙΕΘΝΗ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΑ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΑ

Η Ομάδα για την In Silico Ογκολογία (www.in-silico-oncology.iccs.ntua.gr) του Εργαστηρίου Μικροκυμάτων και Οπτικών Ινών, του Ερευνητικού Πανεπιστημιακού Ινστιτούτο Συστημάτων Επικοινωνιών και Υπολογιστών του Εθνικού Μετσοβίου Πολυτεχνείου (ΕΠΙΣΕΥ-ΕΜΠ), ενδιαφέρεται για την πλήρωση τριών θέσεων ερευνητικής εργασίας, με σύμβαση έργου, στα πλαίσια της υλοποίησης ευρωπαϊκών και διεθνών ερευνητικών προγραμμάτων.

Περισσότερες πληροφορίες

 
5th IARWISOCI -TUMOR project workshop

The 5th International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology and Cancer Investigation (5th IARWISOCI) - TUMOR project workshop will take place in Athens on October 22-23, 2012.
View Workshop Web Page

 
NEW BOOK

" Multiscale Cancer Modeling "

by T.Deisboeck (*) and G. Stamatakos (**) Eds,

CRC Press,2011

[ *Massachusetts General Hospital and Harvard Medical School ,
** Institute of Communication and Computer Systems, National Technical University of Athens]

In both printed and ebook format

More

 
In Silico medicine reaches the clinic

cordis.europa.eu

Forget the monopoly of in vitro, the study of biology in test tubes. The real cutting edge of medical science is in silico, and European researchers have just achieved a world first in the field.

ACGT's most innovative and advanced support tool is its oncosimulator, a piece of mathematical modelling, simulation and visualisation software and an in silico experimental platform.

The In Silico Oncology Group (http://www.in-silico-oncology.iccs.ntua.gr) is developing this platform in collaboration with several research centres in Europe and Japan.

Full article

 
First Summer School in Computational Oncology
Heraklion, Crete, Greece - June 13th-18th, 2011


The summer school is for both clinicians/medical students and engineers/basic scientists/engineering students who wish to learn the principles of computational oncology from pioneers in the field.
The scope of this summer school is to provide basic training on the new research dimension of computational oncology based on the experience of four European collaborative projects in this direction (ACGT, ContraCancrum, TUMOR and pmedicine).
For more information please visit the webpage:
www.computationaloncology.org

 
PROCEEDINGS OF THE 4th INTERNATIONAL ADVANCED RESEARCH WORKSHOP ON IN SILICO ONCOLOGY AND CANCER INVESTIGATION - THE CONTRA CANCRUM WORKSHOP

The Proceedings of the workshop can be downloaded from the workshop website www.4th-iarwisoci.iccs.ntua.gr

 
4th International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology and Cancer Investigation

4th International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology and Cancer Investigation (4th IARWISOCI).
8-9 September 2010
Athens, Greece.

View workshop webpage:
4th IARWISOCI

 
OFFICIAL REPORT ON THE FIRST TRANSATLANTIC WORKSHOP ON MULTISCALE CANCER MODELING, Brussels, Oct. 23-24, 2008

Report

 
1st Transatlantic Workshop on Multiscale Cancer Modelling


1st Transatlantic Workshop on Multiscale Cancer Modelling: an ICT BIO event coorganized by NCI and EC,
October 23-24, 2008
Brussels, Belgium

View the workshop webpage:
ICT BIO 2008

MEDICAL RESEARCH AT CROSSROADS

 
3rd International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology


Third International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology: Advances and Challenges (3rd IARWISO)
September 23-24, 2008 Istanbul, Turkey.

View workshop webpage:
3rd IARWISO