"Less Pain, More Life"      
group members
Georgios S. Stamatakos Director Research Professor
Short Biography    

Georgios S. Stamatakos is Research Professor of Analysis and Simulation of Biological Systems and their Interaction with Electromagnetic Radiation at the Institute of Communication and Computer Systems (ICCS), National Technical University of Athens (NTUA). He is also a Visiting Professor at the School of Electrical and Computer Engineering (SECE), NTUA. He has founded and directs the In Silico Oncology and In Silico Medicine Group of ICCS-SECE-NTUA (www.in-silico-oncology.iccs.ntua.gr). He formulated and proposed the postgraduate course (705-SECE-NTUA) entitled: "Multiscale Cancer Modeling and In Silico Medicine", which he has been teaching in SECE, NTUA since 2014. The latter has been the first postgraduate course dedicated to in silico medicine on a global scale (http://www.vph-institute.org/news/new-postgraduate-subject-on-multiscale-cancer-modelling-and-in-silico-medicine-mscm-ism.html). The course description is available at https://www.ece.ntua.gr/gr/doctoral/courses/33. He holds a Diploma/MSc degree in electrical engineering from NTUA, an MSc degree in bioengineering from the University of Strathclyde, Glasgow, UK, and a Ph.D. degree in physics (biophysics) from NTUA. He has also been a postdoctoral fellow in medical technology at ICCS-NTUA as a National Grant Foundation (IKY) grant recipient. His research interests include, inter alia, in silico oncology, in silico medicine, multiscale cancer modeling, computational medicine, systems medicine, precision medicine, systems biology, bioinformatics, biomedical engineering, bioengineering, bioelectromagnetics, biooptics, computational electromagnetics and applied mathematics. He has proposed the concept and the system of the "Oncosimulator" (video available at https://www.youtube.com/watch?v=fdKHl4ecfwg). He has pioneered the development of the Oncosimulator of the EC and Japan co-funded ACGT Integrated Project, a "world first" (http://cordis.europa.eu/result/rcn/86061_en.html), as well as the Oncosimulators of several other competitive EC funded and international projects mostly centered around the initiative of the Virtual Physiological Human VPH (ContraCancrum, TUMOR, p-medicine, DR THERAPAT, MyHealthAvatar etc.). He was the scientific and the overall coordinator as well as the leader of the fundamental science part of the large scale EU-US integrating research project CHIC on in silico oncology (http://www.chic-vph.eu/). The latter was funded by the European Commission with a grant of 10,582,000 . Seventeen prestigious academic, research and industrial partner organizations across Europe and US participated in CHIC. The CHIC project underwent its final review on 23 and 24 May 2017 and was assessed as "Excellent" by the Board of (five) External Reviewers appointed the European Commission. A short article on the "great achievements" of the CHIC project is available on the website of the European Commission at https://ec.europa.eu/digital-single-market/en/news/great-achievements-eu-funded-chic-project. G. Stamatakos has proposed the term and the concept of "In Silico Oncology" denoting a new clinical trial driven scientific and technological discipline and a precursor of the generic in silico medicine (https://en.wikipedia.org/wiki/In_silico_medicine). He has (co-)initiated and (co-)organized a number of international research workshops, including the IARWISOCI series on in silico oncology ( http://6th-iarwisoci.iccs.ntua.gr/ - including open access to the Proceedings) and the First Transatlantic (EU-US) Workshop on Multiscale Cancer Modeling (ICT 2008, Brussels 2008, http://www.ehealthnews.eu/events/1200-1st-transatlantic-workshop-on-multiscale-cancer-modelling; a video of the opening talk by G. Stamatakos is available at http://ecancer.org/video/105/fundamentals-of-multiscale-modelling.php ). He was co-editor, contributor and reviewer of the transatlantic multi-author textbook entitled "Multiscale Cancer Modeling" published by CRC Press in 2010/2011 (https://www.crcpress.com/Multiscale-Cancer-Modeling/Deisboeck-Stamatakos/p/book/9781439814406 and http://www.crcnetbase.com/doi/abs/10.1201/b10407-1). The co-editor of the book was Tomas Deisboeck, Massachusetts General Hospital and Harvard Medical School. He serves as a referee for numerous scientific peer reviewed journals including Nature Reviews Clinical Oncology and Nature Scientific Reports. G. Stamatakos is a Member of the Editorial Board of Cancer Informatics and a member of IEEE, the Virtual Physiological Human (VPH) Institute and the Technical Chamber of Greece. ORCID webpage: https://orcid.org/0000-0003-2054-477X


ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟ ΜΑΘΗΜΑ 705

ΤΟ ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟ ΜΑΘΗΜΑ ΤΗΣ ΣΧΟΛΗΣ ΗΛΕΚΤΡΟΛΟΓΩΝ ΜΗΧΑΝΙΚΩΝ ΚΑΙ ΜΗΧΑΝΙΚΩΝ ΥΠΟΛΟΓΙΣΤΩΝ ΕΜΠ ME TIΤΛΟ: "(705) Πολυκλιμακωτή Προσομοίωση της Ασθένειας του Καρκίνου και In Silico Ιατρική " ΔΙΔΑΣΚΕΤΑΙ ΓΙΑ TETAΡΤΗ ΧΡΟΝΙΑ ΚΑΤΑ ΤΟ ΧΕΙΜΕΡΙΝΟ ΕΞΑΜΗΝΟ 2017-2018 (Αίθουσα 005, Νέο Κτίριο Ηλεκτρολόγων και ΜΥ, κάθε Παρασκευή κατά τις ώρες 2.00 μμ έως 5.00 μμ.) Περίληψη του μαθήματος υπάρχει στον Οδηγό Μεταπτυχιακών Σπουδών της ΣΗΜΜΥ. Σημειώνεται ότι το εν λόγω μάθημα είναι το πρώτο διεθνώς μεταπτυχιακό μάθημα αφιερωμένο στην αναδυόμενη επιστημονική και τεχνολογική περιοχή της In Silico Ιατρικής.
http://www.vph-institute.org/news/new-postgraduate-subject-on-multiscale-cancer-modelling-and-in-silico-medicine-mscm-ism.html

http://chic-vph.eu/highlights/details/article/first-postgraduate-course-on-in-silico-medicine/

 
ΕΝΑΡΞΗ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ

ΤΟ ΝΕΟ ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟ ΜΑΘΗΜΑ ΤΗΣ ΣΧΟΛΗΣ ΗΛΕΚΤΡΟΛΟΓΩΝ ΜΗΧΑΝΙΚΩΝ ΚΑΙ ΜΗΧΑΝΙΚΩΝ ΥΠΟΛΟΓΙΣΤΩΝ ΕΜΠ ME TIΤΛΟ: "(705) Πολυκλιμακωτή Προσομοίωση της Ασθένειας του Καρκίνου και In Silico Ιατρική " ΔΙΔΑΣΚΕΤΑΙ ΓΙΑ TΡΙΤΗ ΧΡΟΝΙΑ ΚΑΤΑ ΤΟ ΧΕΙΜΕΡΙΝΟ ΕΞΑΜΗΝΟ 2016-2017. Περίληψη του μαθήματος υπάρχει στον Οδηγό Μεταπτυχιακών Σπουδών της ΣΗΜΜΥ. Σημειώνεται ότι το εν λόγω μάθημα είναι το πρώτο διεθνώς μεταπτυχιακό μάθημα αφιερωμένο στην αναδυόμενη επιστημονική και τεχνολογική περιοχή της In Silico Ιατρικής.
http://www.vph-institute.org/news/new-postgraduate-subject-on-multiscale-cancer-modelling-and-in-silico-medicine-mscm-ism.html

http://chic-vph.eu/highlights/details/article/first-postgraduate-course-on-in-silico-medicine/

 
ΑΝΑΒΟΛΗ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ


ΑΝΑΒΟΛΗ ΤΟΥ ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟΥ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ ΤΗΣ ΣΗΜΜΥ ΜΕ ΤΙΤΛΟ (705)

"ΠΟΛΥΚΛΙΜΑΚΩΤΗ ΠΡΟΣΟΜΟΙΩΣΗ
ΤΗΣ ΑΣΘΕΝΕΙΑΣ ΤΟΥ ΚΑΡΚΙΝΟΥ
ΚΑΙ IN SILICO ΙΑΤΡΙΚΗ"
ΤΗΣ ΠΑΡΑΣΚΕΥΗΣ 23 ΟΚΤΩΒΡΙΟΥ 2015 ΑΝΑΒΑΛΛΕΤΑΙ ΛΟΓΩ ΑΝΕΛΑΣΤΙΚΗΣ ΑΠΟΥΣΙΑΣ ΤΟΥ ΔΙΔΑΣΚΟΝΤΑ ΣΤΟ ΕΞΩΤΕΡΙΚΟ. ΤΟ ΜΑΘΗΜΑ ΤΗΣ 30ης ΟΚΤ. ΘΑ ΓΙΝΕΙ ΚΑΝΟΝΙΚΑ

 


ΕΝΑΡΞΗ ΤΟΥ ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟΥ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ ΤΗΣ ΣΗΜΜΥ ΜΕ ΤΙΤΛΟ (705)

"ΠΟΛΥΚΛΙΜΑΚΩΤΗ ΠΡΟΣΟΜΟΙΩΣΗ
ΤΗΣ ΑΣΘΕΝΕΙΑΣ ΤΟΥ ΚΑΡΚΙΝΟΥ
ΚΑΙ IN SILICO ΙΑΤΡΙΚΗ"


Διδάσκων: Γ. Σταματάκος
Ημέρα:Παρασκευή 16 Οκτωβρίου 2015
(και κάθε Παρασκευή)
Ωρες: 13.45-17.00
Κτήριο: Nέo Κτίριο ΣΗΜΜΥ
Αιθουσα: 101, 1os όροφος
Επικοινωνία:gestam@central.ntua.gr

Περισσότερες πληροφορίες

Εισήγηση,Τεκμηρίωση, Διδακτικό Υλικό και Αναλυτική Περιγραφή του Νέου Μεταπτ. Μαθήματος της ΣΗΜΜΥ

New postgraduate subject on Multiscale Cancer Modelling and In Silico Medicine (MSCM & ISM)/VPH Institute

 
IEEE XPLORE PUBLICATION OF PROCEEDINGS


The Proceedings of the 6th International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology and Cancer Investigation - The CHIC Project Workshop (6th IARWISOCI) have been published - following the standard IEEE review - in the IEEE Xplore Digital Library

http://ieeexplore.ieee.org/xpl/mostRecentIssue.jsp?punumber=7024236

Since except for the editorial, the abstracts and some additional front matter, downloading of any paper requires either a special subscription to IEEE or electronic payment, you might prefer to cite any paper through its IEEE Xplore publication and at the same time read and disseminate it for free via its open access publication

THE CHIC PROJECT WORKSHOP 2014 PROCEEDINGS OPEN ACCESS VERSION.pdf

which resides in the workshop website http://6th-iarwisoci.iccs.ntua.gr/. It is noted that a special agreement with IEEE has been signed regarding the parallel open access and IEEE Xplore publishing of the proceedings.

 
ΘΕΣΗ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΗΣ ΕΡΓΑΣΙΑΣ

Η ΘΕΣΗ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΕΧΕΙ ΚΑΛΥΦΘΕΙ

Η Ομάδα για την In Silico Ογκολογία και την In Silico Ιατρική (www.in-silico-oncology.iccs.ntua.gr) του Εργαστηρίου Μικροκυμάτων και Οπτικών Ινών, του Ερευνητικού Πανεπιστημιακού Ινστιτούτου Συστημάτων Επικοινωνιών και Υπολογιστών του Εθνικού Μετσοβίου Πολυτεχνείου (ΕΠΙΣΕΥ-ΕΜΠ), ενδιαφέρεται για την πλήρωση μίας θέσης ερευνητικής εργασίας, με σύμβαση έργου, στα πλαίσια της υλοποίησης ευρωπαϊκών και διεθνών ερευνητικών προγραμμάτων.

Η θέση εργασίας αφορά στην περιοχή της πολυεπίπεδης/πολυκλιμακωτής υπολογιστικής προσομοίωσης του καρκίνου και της in silico ογκολογίας. Οι υποψήφιοι μπορεί να είναι διπλωματούχοι ή διδάκτορες Ηλεκτρολόγοι Μηχανικοί και Μηχανικοί Υπολογιστών ή διπλωματούχοι/διδάκτορες άλλων Πολυτεχνικών Σχολών ή Σχολών Πληροφορικής με ειδίκευση στις Τεχνολογίες Λογισμικού.

Θα επιλεγούν υποψήφιοι χωρίς άλλες σπουδαστικές, επαγγελματικές ή ακαδημαϊκές υποχρεώσεις έτσι ώστε να μπορέσουν να αφοσιωθούν αποκλειστικά στις ερευνητικές δραστηριότητες της ομάδας. Το ύψος της αμοιβής θα προσδιοριστεί ανάλογα με την επιστημονική εξειδίκευση και την εμπειρία των υποψηφίων. Το ενδεχόμενο εκπόνησης διδακτορικής διατριβής για μη κατόχους διδακτορικού διπλώματος στα παραπάνω πλαίσια θα εξεταστεί κατά περίπτωση.

Οι υποψήφιοι θα πρέπει να ενδιαφέρονται για την εφαρμογή των τεχνολογιών λογισμικού στο χώρο της in silico (υπολογιστικής) Ιατρικής και Βιολογίας. Συγκεκριμένα, η θέση εργασίας αφορά στους εξής βασικούς άξονες:

* Ανάπτυξη υπολογιστικών συστημάτων αποθήκευσης και διαχείρισης ογκοπροσομοιωτικών μοντέλων και αντίστοιχων πολυκλιμακωτών ιατρικών/βιολογικών δεδομένων (σχεδιασμός και υλοποίηση σχετικών λογισμικών υποδομής και διεπιφανειών χρήστη).
* Σχεδιασμός, υλοποίηση και έλεγχος της αρχιτεκτονικής σύνθετων συστημάτων λογισμικού τα οποία θα προσλαμβάνουν, θα αποθηκεύουν και θα επεξεργάζονται ετερογενή και πολυδιάστατα βιοϊατρικά δεδομένα, θα εκτελούν σχετικούς υπολογιστικούς κώδικες σε συστήματα υψηλής υπολογιστικής απόδοσης (clusters, grid, cloud κλπ.) και θα οπτικοποιούν τα αποτελέσματα παρέχοντας εξόδους σε μορφές φιλικές προς το χρήστη.

Επιθυμητές γνώσεις/εμπειρία:

* Εκτεταμένες γνώσεις επιστήμης υπολογιστών.
* Θα εκτιμηθούν ιδιαίτερα ειδικές γνώσεις/εμπειρία σε: relational databases (e.g. MySQL, PostgressSQL), web application technologies (e.g. AJAX, Javascript, PHP, Python), NoSQL databases (MongoDB), virtualization and cloud computing, C++/Matlab/SBML/Java programming, Semantics and Ontologies (e.g. MarkUp Languages, RDF, OWL, Triple Stores, SPARQL).

Πρόσθετα Επιθυμητά χαρακτηριστικά:

* Αναλυτική και συνδυαστική ικανότητα.
* Ικανότητα συνεργασίας σε διεθνές και διεπιστημονικό περιβάλλον εργασίας.

Οι ενδιαφερόμενοι παρακαλούνται να αποστείλουν το συντομότερο δυνατό το βιογραφικό τους σημείωμα στις ηλεκτρονικές διευθύνσεις:

gestam@central.ntua.gr και dimdio@esd.ece.ntua.gr

Αθήνα, 8 Μαΐου 2014

Γ. Σταματάκος
Ερευνητής Α ΕΠΙΣΕΥ-ΕΜΠ
Διευθυντής Ερευνών

Download
------------------------------------------------------------

 
ΘΕΣΗ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΣΕ ΕΥΡΩΠΑЇΚΑ KAI ΔΙΕΘΝΗ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΑ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΑ

Η Ομάδα για την In Silico Ογκολογία (www.in-silico-oncology.iccs.ntua.gr) του Εργαστηρίου Μικροκυμάτων και Οπτικών Ινών, του Ερευνητικού Πανεπιστημιακού Ινστιτούτου Συστημάτων Επικοινωνιών και Υπολογιστών του Εθνικού Μετσοβίου Πολυτεχνείου (ΕΠΙΣΕΥ-ΕΜΠ), ενδιαφέρεται για την πλήρωση μίας θέσης ερευνητικής εργασίας, με σύμβαση έργου, στα πλαίσια της υλοποίησης ευρωπαϊκών και διεθνών ερευνητικών προγραμμάτων.

Περισσότερες πληροφορίες

 
CHIC project presented in The Parliament Magazine

A one page general public article on the CHIC project has been published in The Parliament Magazine 389, 28 April 2014, p. 36.

More

 
ΘΕΣΕΙΣ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΣΕ ΕΥΡΩΠΑЇΚΑ KAI ΔΙΕΘΝΗ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΑ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΑ

ΟΙ ΘΕΣΕΙΣ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΕΧΟΥΝ ΚΑΛΥΦΘΕΙ

ΘΕΣΕΙΣ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΣΕ ΕΥΡΩΠΑЇΚΑ KAI ΔΙΕΘΝΗ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΑ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΑ

Η Ομάδα για την In Silico Ογκολογία (www.in-silico-oncology.iccs.ntua.gr) του Εργαστηρίου Μικροκυμάτων και Οπτικών Ινών, του Ερευνητικού Πανεπιστημιακού Ινστιτούτο Συστημάτων Επικοινωνιών και Υπολογιστών του Εθνικού Μετσοβίου Πολυτεχνείου (ΕΠΙΣΕΥ-ΕΜΠ), ενδιαφέρεται για την πλήρωση τριών θέσεων ερευνητικής εργασίας, με σύμβαση έργου, στα πλαίσια της υλοποίησης ευρωπαϊκών και διεθνών ερευνητικών προγραμμάτων.

Περισσότερες πληροφορίες

 
5th IARWISOCI -TUMOR project workshop

The 5th International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology and Cancer Investigation (5th IARWISOCI) - TUMOR project workshop will take place in Athens on October 22-23, 2012.
View Workshop Web Page

 
NEW BOOK

" Multiscale Cancer Modeling "

by T.Deisboeck (*) and G. Stamatakos (**) Eds,

CRC Press,2011

[ *Massachusetts General Hospital and Harvard Medical School ,
** Institute of Communication and Computer Systems, National Technical University of Athens]

In both printed and ebook format

More

 
In Silico medicine reaches the clinic

cordis.europa.eu

Forget the monopoly of in vitro, the study of biology in test tubes. The real cutting edge of medical science is in silico, and European researchers have just achieved a world first in the field.

ACGT's most innovative and advanced support tool is its oncosimulator, a piece of mathematical modelling, simulation and visualisation software and an in silico experimental platform.

The In Silico Oncology Group (http://www.in-silico-oncology.iccs.ntua.gr) is developing this platform in collaboration with several research centres in Europe and Japan.

Full article

 
First Summer School in Computational Oncology
Heraklion, Crete, Greece - June 13th-18th, 2011


The summer school is for both clinicians/medical students and engineers/basic scientists/engineering students who wish to learn the principles of computational oncology from pioneers in the field.
The scope of this summer school is to provide basic training on the new research dimension of computational oncology based on the experience of four European collaborative projects in this direction (ACGT, ContraCancrum, TUMOR and pmedicine).
For more information please visit the webpage:
www.computationaloncology.org

 
PROCEEDINGS OF THE 4th INTERNATIONAL ADVANCED RESEARCH WORKSHOP ON IN SILICO ONCOLOGY AND CANCER INVESTIGATION - THE CONTRA CANCRUM WORKSHOP

The Proceedings of the workshop can be downloaded from the workshop website www.4th-iarwisoci.iccs.ntua.gr

 
4th International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology and Cancer Investigation

4th International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology and Cancer Investigation (4th IARWISOCI).
8-9 September 2010
Athens, Greece.

View workshop webpage:
4th IARWISOCI

 
OFFICIAL REPORT ON THE FIRST TRANSATLANTIC WORKSHOP ON MULTISCALE CANCER MODELING, Brussels, Oct. 23-24, 2008

Report

 
1st Transatlantic Workshop on Multiscale Cancer Modelling


1st Transatlantic Workshop on Multiscale Cancer Modelling: an ICT BIO event coorganized by NCI and EC,
October 23-24, 2008
Brussels, Belgium

View the workshop webpage:
ICT BIO 2008

MEDICAL RESEARCH AT CROSSROADS

 
3rd International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology


Third International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology: Advances and Challenges (3rd IARWISO)
September 23-24, 2008 Istanbul, Turkey.

View workshop webpage:
3rd IARWISO