"Less Pain, More Life"      

projects

CHIC

Computational Horizons In Cancer(CHIC): Developing Meta- and Hyper-Multiscale Models and Repositories for In Silico Oncology

CHIC proposes the development of clinical trial driven tools, services and infrastructures that will support the creation of multiscale cancer hypermodels (integrative models). CHIC aspires to make a breakthrough in multiscale cancer modeling through greatly facilitating multi-modeller cancer hypermodelling and its clinical adaptation and validation. Standardization of model description and model fusion will be two of the core means to achieve this goal. The creation of such elaborate and refined hypermodels is expected to sharply accelerate the clinical translation of multiscale cancer models and oncosimulators following their prospective clinical validation (in silico oncology). Website

DR THERAPAT

The Digital Radiation Therapy Patient

DR THERAPATs aim is to create the Digital Radiation Therapy Patient platform. This platform will integrate available knowledge on tumor imaging, image analysis and interpretation, radiobiological models and radiation therapy planning into a coherent, reusable, multi-scale digital representation. Radiation therapy was chosen as the application to prove the integration of those concepts since inherently imaging plays a major role in radiation therapy planning and delivery, so the imaging information is available as input for various models, and the delivery process is relatively well understood, making the model validation easier compared to e.g. chemotherapy. Website

My Health Avatar

Owing to the highly fragmented health systems in European countries, gaining access to a consistent record of individual citizens that involves cross-border activities is very difficult. MyHealthAvatar is a proof of concept for the digital representation of patient health status. It is designed as a lifetime companion for individual citizens that facilitates the collection of, and access to, long-term health-status information. This is extremely valuable for clinical decisions and offers a promising approach to acquire population data to support clinical research, leading to strengthened multidisciplinary research excellence in supporting innovative medical care.
Website

p-Medicine [Personalized Medicine]

The In Silico Oncology Group of ICCS-NTUA will lead the action: "VPH (Virtual Physiological Human) Modelling and the Integrated Oncosimulator" of this integrated four year project, jointly financed by the European Commission and Japan under the FP7 Programme. Website

TUMOR [Transatlantic Tumor Model Repositories ]

ICCS-NTUA-In Silico Oncology Group is the leader of the actions "Transatlantic scenarios definition and application on shared models/data" and "Dissemination" of the EC funded project "TUMOR: Transatlantic TUmor Model Repositories (FP7-ICT-2009.5.4-247754 )". Website


ContraCancrum [ Clinically Oriented Cancer Multilevel Modelling ]

ICCS-NTUA-In Silico Oncology Group is the leader of the actions "Simulation at the cellular and higher levels of biocomplexity" and "Integration of the Simulation System" of the EC funded specific targeted research project "ContraCancrum: Clinically Oriented Translational Cancer Multilevel Modelling (FP7-ICT-2007-2- 223979 )" Website.


ACGT [Advancing Clinicogenomic Trials on Cancer]

ICCS-NTUA-In Silico Oncology Group was the leader of the action Technologies and Tools for In Silico Oncology of the European Commision (EC)and Japan funded integrated project ACGT (FP6-2005-IST-026996). Website.


Network of Excellence on the Virtual Physiological Human (NoE on VPH)

ICCS-NTUA-In Silico Oncology Group is participating in the EC funded Network of Excellence on the Virtual Physiological Human ( FP7-ICT-2007-2 NoE VPH) through the European Consortium for Informatics and Mathematics Digital Patient Working Group. Website


Center for the Development of a Virtual Tumor (CViT)

The The ISOG Group Leader is a member of the Center for the Development of a Virtual Tumor (CViT) which is supported by the US NIH-National Cancer Institute through the Integrative Cancer Biology Program (CA113004).


ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟ ΜΑΘΗΜΑ 705

ΤΟ ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟ ΜΑΘΗΜΑ ΤΗΣ ΣΧΟΛΗΣ ΗΛΕΚΤΡΟΛΟΓΩΝ ΜΗΧΑΝΙΚΩΝ ΚΑΙ ΜΗΧΑΝΙΚΩΝ ΥΠΟΛΟΓΙΣΤΩΝ ΕΜΠ ME TIΤΛΟ: "(705) Πολυκλιμακωτή Προσομοίωση της Ασθένειας του Καρκίνου και In Silico Ιατρική " ΔΙΔΑΣΚΕΤΑΙ ΓΙΑ TETAΡΤΗ ΧΡΟΝΙΑ ΚΑΤΑ ΤΟ ΧΕΙΜΕΡΙΝΟ ΕΞΑΜΗΝΟ 2017-2018 (Αίθουσα 005, Νέο Κτίριο Ηλεκτρολόγων και ΜΥ, κάθε Παρασκευή κατά τις ώρες 2.00 μμ έως 5.00 μμ.) Περίληψη του μαθήματος υπάρχει στον Οδηγό Μεταπτυχιακών Σπουδών της ΣΗΜΜΥ. Σημειώνεται ότι το εν λόγω μάθημα είναι το πρώτο διεθνώς μεταπτυχιακό μάθημα αφιερωμένο στην αναδυόμενη επιστημονική και τεχνολογική περιοχή της In Silico Ιατρικής.
http://www.vph-institute.org/news/new-postgraduate-subject-on-multiscale-cancer-modelling-and-in-silico-medicine-mscm-ism.html

http://chic-vph.eu/highlights/details/article/first-postgraduate-course-on-in-silico-medicine/

 
ΕΝΑΡΞΗ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ

ΤΟ ΝΕΟ ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟ ΜΑΘΗΜΑ ΤΗΣ ΣΧΟΛΗΣ ΗΛΕΚΤΡΟΛΟΓΩΝ ΜΗΧΑΝΙΚΩΝ ΚΑΙ ΜΗΧΑΝΙΚΩΝ ΥΠΟΛΟΓΙΣΤΩΝ ΕΜΠ ME TIΤΛΟ: "(705) Πολυκλιμακωτή Προσομοίωση της Ασθένειας του Καρκίνου και In Silico Ιατρική " ΔΙΔΑΣΚΕΤΑΙ ΓΙΑ TΡΙΤΗ ΧΡΟΝΙΑ ΚΑΤΑ ΤΟ ΧΕΙΜΕΡΙΝΟ ΕΞΑΜΗΝΟ 2016-2017. Περίληψη του μαθήματος υπάρχει στον Οδηγό Μεταπτυχιακών Σπουδών της ΣΗΜΜΥ. Σημειώνεται ότι το εν λόγω μάθημα είναι το πρώτο διεθνώς μεταπτυχιακό μάθημα αφιερωμένο στην αναδυόμενη επιστημονική και τεχνολογική περιοχή της In Silico Ιατρικής.
http://www.vph-institute.org/news/new-postgraduate-subject-on-multiscale-cancer-modelling-and-in-silico-medicine-mscm-ism.html

http://chic-vph.eu/highlights/details/article/first-postgraduate-course-on-in-silico-medicine/

 
ΑΝΑΒΟΛΗ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ


ΑΝΑΒΟΛΗ ΤΟΥ ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟΥ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ ΤΗΣ ΣΗΜΜΥ ΜΕ ΤΙΤΛΟ (705)

"ΠΟΛΥΚΛΙΜΑΚΩΤΗ ΠΡΟΣΟΜΟΙΩΣΗ
ΤΗΣ ΑΣΘΕΝΕΙΑΣ ΤΟΥ ΚΑΡΚΙΝΟΥ
ΚΑΙ IN SILICO ΙΑΤΡΙΚΗ"
ΤΗΣ ΠΑΡΑΣΚΕΥΗΣ 23 ΟΚΤΩΒΡΙΟΥ 2015 ΑΝΑΒΑΛΛΕΤΑΙ ΛΟΓΩ ΑΝΕΛΑΣΤΙΚΗΣ ΑΠΟΥΣΙΑΣ ΤΟΥ ΔΙΔΑΣΚΟΝΤΑ ΣΤΟ ΕΞΩΤΕΡΙΚΟ. ΤΟ ΜΑΘΗΜΑ ΤΗΣ 30ης ΟΚΤ. ΘΑ ΓΙΝΕΙ ΚΑΝΟΝΙΚΑ

 


ΕΝΑΡΞΗ ΤΟΥ ΜΕΤΑΠΤΥΧΙΑΚΟΥ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ ΤΗΣ ΣΗΜΜΥ ΜΕ ΤΙΤΛΟ (705)

"ΠΟΛΥΚΛΙΜΑΚΩΤΗ ΠΡΟΣΟΜΟΙΩΣΗ
ΤΗΣ ΑΣΘΕΝΕΙΑΣ ΤΟΥ ΚΑΡΚΙΝΟΥ
ΚΑΙ IN SILICO ΙΑΤΡΙΚΗ"


Διδάσκων: Γ. Σταματάκος
Ημέρα:Παρασκευή 16 Οκτωβρίου 2015
(και κάθε Παρασκευή)
Ωρες: 13.45-17.00
Κτήριο: Nέo Κτίριο ΣΗΜΜΥ
Αιθουσα: 101, 1os όροφος
Επικοινωνία:gestam@central.ntua.gr

Περισσότερες πληροφορίες

Εισήγηση,Τεκμηρίωση, Διδακτικό Υλικό και Αναλυτική Περιγραφή του Νέου Μεταπτ. Μαθήματος της ΣΗΜΜΥ

New postgraduate subject on Multiscale Cancer Modelling and In Silico Medicine (MSCM & ISM)/VPH Institute

 
IEEE XPLORE PUBLICATION OF PROCEEDINGS


The Proceedings of the 6th International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology and Cancer Investigation - The CHIC Project Workshop (6th IARWISOCI) have been published - following the standard IEEE review - in the IEEE Xplore Digital Library

http://ieeexplore.ieee.org/xpl/mostRecentIssue.jsp?punumber=7024236

Since except for the editorial, the abstracts and some additional front matter, downloading of any paper requires either a special subscription to IEEE or electronic payment, you might prefer to cite any paper through its IEEE Xplore publication and at the same time read and disseminate it for free via its open access publication

THE CHIC PROJECT WORKSHOP 2014 PROCEEDINGS OPEN ACCESS VERSION.pdf

which resides in the workshop website http://6th-iarwisoci.iccs.ntua.gr/. It is noted that a special agreement with IEEE has been signed regarding the parallel open access and IEEE Xplore publishing of the proceedings.

 
ΘΕΣΗ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΗΣ ΕΡΓΑΣΙΑΣ

Η ΘΕΣΗ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΕΧΕΙ ΚΑΛΥΦΘΕΙ

Η Ομάδα για την In Silico Ογκολογία και την In Silico Ιατρική (www.in-silico-oncology.iccs.ntua.gr) του Εργαστηρίου Μικροκυμάτων και Οπτικών Ινών, του Ερευνητικού Πανεπιστημιακού Ινστιτούτου Συστημάτων Επικοινωνιών και Υπολογιστών του Εθνικού Μετσοβίου Πολυτεχνείου (ΕΠΙΣΕΥ-ΕΜΠ), ενδιαφέρεται για την πλήρωση μίας θέσης ερευνητικής εργασίας, με σύμβαση έργου, στα πλαίσια της υλοποίησης ευρωπαϊκών και διεθνών ερευνητικών προγραμμάτων.

Η θέση εργασίας αφορά στην περιοχή της πολυεπίπεδης/πολυκλιμακωτής υπολογιστικής προσομοίωσης του καρκίνου και της in silico ογκολογίας. Οι υποψήφιοι μπορεί να είναι διπλωματούχοι ή διδάκτορες Ηλεκτρολόγοι Μηχανικοί και Μηχανικοί Υπολογιστών ή διπλωματούχοι/διδάκτορες άλλων Πολυτεχνικών Σχολών ή Σχολών Πληροφορικής με ειδίκευση στις Τεχνολογίες Λογισμικού.

Θα επιλεγούν υποψήφιοι χωρίς άλλες σπουδαστικές, επαγγελματικές ή ακαδημαϊκές υποχρεώσεις έτσι ώστε να μπορέσουν να αφοσιωθούν αποκλειστικά στις ερευνητικές δραστηριότητες της ομάδας. Το ύψος της αμοιβής θα προσδιοριστεί ανάλογα με την επιστημονική εξειδίκευση και την εμπειρία των υποψηφίων. Το ενδεχόμενο εκπόνησης διδακτορικής διατριβής για μη κατόχους διδακτορικού διπλώματος στα παραπάνω πλαίσια θα εξεταστεί κατά περίπτωση.

Οι υποψήφιοι θα πρέπει να ενδιαφέρονται για την εφαρμογή των τεχνολογιών λογισμικού στο χώρο της in silico (υπολογιστικής) Ιατρικής και Βιολογίας. Συγκεκριμένα, η θέση εργασίας αφορά στους εξής βασικούς άξονες:

* Ανάπτυξη υπολογιστικών συστημάτων αποθήκευσης και διαχείρισης ογκοπροσομοιωτικών μοντέλων και αντίστοιχων πολυκλιμακωτών ιατρικών/βιολογικών δεδομένων (σχεδιασμός και υλοποίηση σχετικών λογισμικών υποδομής και διεπιφανειών χρήστη).
* Σχεδιασμός, υλοποίηση και έλεγχος της αρχιτεκτονικής σύνθετων συστημάτων λογισμικού τα οποία θα προσλαμβάνουν, θα αποθηκεύουν και θα επεξεργάζονται ετερογενή και πολυδιάστατα βιοϊατρικά δεδομένα, θα εκτελούν σχετικούς υπολογιστικούς κώδικες σε συστήματα υψηλής υπολογιστικής απόδοσης (clusters, grid, cloud κλπ.) και θα οπτικοποιούν τα αποτελέσματα παρέχοντας εξόδους σε μορφές φιλικές προς το χρήστη.

Επιθυμητές γνώσεις/εμπειρία:

* Εκτεταμένες γνώσεις επιστήμης υπολογιστών.
* Θα εκτιμηθούν ιδιαίτερα ειδικές γνώσεις/εμπειρία σε: relational databases (e.g. MySQL, PostgressSQL), web application technologies (e.g. AJAX, Javascript, PHP, Python), NoSQL databases (MongoDB), virtualization and cloud computing, C++/Matlab/SBML/Java programming, Semantics and Ontologies (e.g. MarkUp Languages, RDF, OWL, Triple Stores, SPARQL).

Πρόσθετα Επιθυμητά χαρακτηριστικά:

* Αναλυτική και συνδυαστική ικανότητα.
* Ικανότητα συνεργασίας σε διεθνές και διεπιστημονικό περιβάλλον εργασίας.

Οι ενδιαφερόμενοι παρακαλούνται να αποστείλουν το συντομότερο δυνατό το βιογραφικό τους σημείωμα στις ηλεκτρονικές διευθύνσεις:

gestam@central.ntua.gr και dimdio@esd.ece.ntua.gr

Αθήνα, 8 Μαΐου 2014

Γ. Σταματάκος
Ερευνητής Α ΕΠΙΣΕΥ-ΕΜΠ
Διευθυντής Ερευνών

Download
------------------------------------------------------------

 
ΘΕΣΗ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΣΕ ΕΥΡΩΠΑЇΚΑ KAI ΔΙΕΘΝΗ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΑ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΑ

Η Ομάδα για την In Silico Ογκολογία (www.in-silico-oncology.iccs.ntua.gr) του Εργαστηρίου Μικροκυμάτων και Οπτικών Ινών, του Ερευνητικού Πανεπιστημιακού Ινστιτούτου Συστημάτων Επικοινωνιών και Υπολογιστών του Εθνικού Μετσοβίου Πολυτεχνείου (ΕΠΙΣΕΥ-ΕΜΠ), ενδιαφέρεται για την πλήρωση μίας θέσης ερευνητικής εργασίας, με σύμβαση έργου, στα πλαίσια της υλοποίησης ευρωπαϊκών και διεθνών ερευνητικών προγραμμάτων.

Περισσότερες πληροφορίες

 
CHIC project presented in The Parliament Magazine

A one page general public article on the CHIC project has been published in The Parliament Magazine 389, 28 April 2014, p. 36.

More

 
ΘΕΣΕΙΣ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΣΕ ΕΥΡΩΠΑЇΚΑ KAI ΔΙΕΘΝΗ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΑ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΑ

ΟΙ ΘΕΣΕΙΣ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΕΧΟΥΝ ΚΑΛΥΦΘΕΙ

ΘΕΣΕΙΣ ΕΡΓΑΣΙΑΣ ΣΕ ΕΥΡΩΠΑЇΚΑ KAI ΔΙΕΘΝΗ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΑ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΑ

Η Ομάδα για την In Silico Ογκολογία (www.in-silico-oncology.iccs.ntua.gr) του Εργαστηρίου Μικροκυμάτων και Οπτικών Ινών, του Ερευνητικού Πανεπιστημιακού Ινστιτούτο Συστημάτων Επικοινωνιών και Υπολογιστών του Εθνικού Μετσοβίου Πολυτεχνείου (ΕΠΙΣΕΥ-ΕΜΠ), ενδιαφέρεται για την πλήρωση τριών θέσεων ερευνητικής εργασίας, με σύμβαση έργου, στα πλαίσια της υλοποίησης ευρωπαϊκών και διεθνών ερευνητικών προγραμμάτων.

Περισσότερες πληροφορίες

 
5th IARWISOCI -TUMOR project workshop

The 5th International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology and Cancer Investigation (5th IARWISOCI) - TUMOR project workshop will take place in Athens on October 22-23, 2012.
View Workshop Web Page

 
NEW BOOK

" Multiscale Cancer Modeling "

by T.Deisboeck (*) and G. Stamatakos (**) Eds,

CRC Press,2011

[ *Massachusetts General Hospital and Harvard Medical School ,
** Institute of Communication and Computer Systems, National Technical University of Athens]

In both printed and ebook format

More

 
In Silico medicine reaches the clinic

cordis.europa.eu

Forget the monopoly of in vitro, the study of biology in test tubes. The real cutting edge of medical science is in silico, and European researchers have just achieved a world first in the field.

ACGT's most innovative and advanced support tool is its oncosimulator, a piece of mathematical modelling, simulation and visualisation software and an in silico experimental platform.

The In Silico Oncology Group (http://www.in-silico-oncology.iccs.ntua.gr) is developing this platform in collaboration with several research centres in Europe and Japan.

Full article

 
First Summer School in Computational Oncology
Heraklion, Crete, Greece - June 13th-18th, 2011


The summer school is for both clinicians/medical students and engineers/basic scientists/engineering students who wish to learn the principles of computational oncology from pioneers in the field.
The scope of this summer school is to provide basic training on the new research dimension of computational oncology based on the experience of four European collaborative projects in this direction (ACGT, ContraCancrum, TUMOR and pmedicine).
For more information please visit the webpage:
www.computationaloncology.org

 
PROCEEDINGS OF THE 4th INTERNATIONAL ADVANCED RESEARCH WORKSHOP ON IN SILICO ONCOLOGY AND CANCER INVESTIGATION - THE CONTRA CANCRUM WORKSHOP

The Proceedings of the workshop can be downloaded from the workshop website www.4th-iarwisoci.iccs.ntua.gr

 
4th International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology and Cancer Investigation

4th International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology and Cancer Investigation (4th IARWISOCI).
8-9 September 2010
Athens, Greece.

View workshop webpage:
4th IARWISOCI

 
OFFICIAL REPORT ON THE FIRST TRANSATLANTIC WORKSHOP ON MULTISCALE CANCER MODELING, Brussels, Oct. 23-24, 2008

Report

 
1st Transatlantic Workshop on Multiscale Cancer Modelling


1st Transatlantic Workshop on Multiscale Cancer Modelling: an ICT BIO event coorganized by NCI and EC,
October 23-24, 2008
Brussels, Belgium

View the workshop webpage:
ICT BIO 2008

MEDICAL RESEARCH AT CROSSROADS

 
3rd International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology


Third International Advanced Research Workshop on In Silico Oncology: Advances and Challenges (3rd IARWISO)
September 23-24, 2008 Istanbul, Turkey.

View workshop webpage:
3rd IARWISO